八月底的时候，关于北京城中的李闯大军出动进攻山海关的消息已经传到了南京。南京也因此变得沸沸扬扬，山海关已经是大明在北方仅有的据点，吴三桂孤军守卫的事实在民间和朝中也有不错的风评。此次大顺军十余万向山海关紧逼，让南京的朝野民众更增添了一丝悲壮的情绪。
东林党人不失时机的在民间推动北伐的事宜，也争取到了大量的士子、百姓声援，相比较之下，朝中却是并没有多大的反应。朱慈烺尽管是一力主张，但支持的朝臣寥寥无几。
义兴朝的几大镇将，回到山东的朱平安却是甚为积极，已经上表言明，一旦朝廷决意北伐，那山东之军将立刻向西展开攻势。不过，他的表章却是被朱慈烺留中，并没有任何的回音。
其余人等，郑芝龙虽是也上表附和，但其人远在福建，远水不解近渴；刘良佐和黄得功因为辅佐福王登基的事情，现在都是小心翼翼，不敢妄动；左良玉回到武昌抱病不出，其想法外人不得而知。
在这纷乱之中，原先参与福王登位的一众人等却是被人摒除在了视线之外。义兴皇帝登基之后，朝臣中有人建议，新朝甫立，应以宽大为怀，当初马士英等人拥立福王，不过是担心大明国嗣后继无人，从立意之本不能说是完全错误的。如今朝中正局已立，再因此而多造杀孽，于皇帝本身并无益处。更何况姜曰广、张慎言、高弘图等人都是主政南京的老臣，于国于社稷多有建树，因为此事而将他们处死，却是显得义兴皇帝并无容人之量了。
因此，朱慈烺特意下诏，将姜曰广、张慎言和高弘图等人赦免，打发到广西、云贵等地去做地方官。但是对于马士英、刘孔昭、阮大铖等首要之人，却还是将其拘押南京的锦衣卫诏狱之中，并无半点宽宥之意。福王朱由崧，也依旧被关押在宗人府中，他毕竟是朱慈烺的叔父辈，虽没有性命之虞，但这辈子却是别想重见天日了。
如今南京的锦衣卫指挥使，是崇祯朝时，代掌锦衣卫事的东司房提督吴孟明的儿子吴邦辅。周延儒倒台后，骆养性也随即被免官，接替他的正是吴孟明。京师陷落时，吴孟明在王承恩麾下守卫内城，战死于乱军之中。朱慈烺念其忠义，便以他的儿子吴邦辅为继任锦衣卫指挥使。
现在的吴邦辅却完全没有新官上任的春风得意，有的只是无穷无尽的头痛欲裂。
与崇祯皇帝不同，义兴帝朱慈烺明显也吸收了自己父亲当年执政时的一些不足之处，着意以锦衣卫和东厂加强对朝局的控制。可是，他却没有思虑到，如今的厂卫怎么能和以前相提并论呢？明知不可为而为之，这不是将锦衣卫和吴邦辅架在火上去烤吗？
南京历来便处在勋贵和文臣们的掌控之下，锦衣卫衙门不过是虚有其表，一直受京师锦衣卫节制，并没有太多的作为。骤然间，重担一股脑的压下来，还要立竿见影的收到成效，也难怪吴邦辅力不从心。
更令人窝火的是，所谓锦衣卫的诏狱中如今还关押着几尊“大佛”，宫里面到现在也没说关于这些人的处理办法，只能是积压在吴邦辅这里。
马士英、阮大铖、刘孔昭这三个人，都是南京城里只手遮天的人物，脚步一沉，整个南京城都要晃上一晃，如今虽然在狱中，但锦衣卫这个挂了名号的所谓诏狱就真能关得住他们吗？
这些人到了现在，已经无所顾忌，可吴邦辅却没有胆子和他们玉石俱焚。进入诏狱的这些天以来，不少人透过明里暗里的渠道来看望马士英等人，吴邦辅便清楚的知道，这些人所图谋的事情，不是他这个名不副实的锦衣卫指挥使可以控制的。
这不一大早，马士英的公子马鸾便早早的登门了。加入福王朱由崧成功登位，眼前的这位马公子便是如今的锦衣卫指挥使了。马家在江南树大根深，别的而不说，但是在这锦衣卫衙门中，他们的影响力便不是吴邦辅这各从京师而来的外来户可以比拟的。
马鸾的态度还算恭谨，看到吴邦辅就在官厅中就座，并没有直接的向后院的诏狱而去，而是客客气气的请见，说了两句不咸不淡的闲话，接着便将一份礼单随手放在吴邦辅的公案上，，这才施施然的告辞向诏狱而去。
现实就是这样，锦衣卫指挥使不过是个好看些的摆设而已。吴邦辅对于自己的定位心知肚明，盘算着这些天挣下的钱财，吴邦辅暗自打定了主意，反正如今世道正乱，等过些日子，便径直挂冠而去，到山东贸易区去找些生意来做，既安稳、又自在，又何必在南京做这两头受气的官呢？
锦衣卫的诏狱，远不如京师镇抚司衙门来的气派，不过是南京锦衣卫衙门后面的一排砖房而已。马士英三人便被关押在其中，虽是钦犯，但却占了其中最好的三间房，为避免与外界接触，锦衣卫衙门还砌起一堵院墙，将三人的房间牢牢的封在其中。如此一来，倒是让三人有了独立的空间。