在美国对轴心国宣战后，海军司令部便命令潜艇司令部派潜艇对美国及加勒比沿岸的航线进行袭击。
最初潜艇部队对航行在美国东部航线上的运输船只的攻击十分容易，美国在参战后根本没有建立护航机制和灯火管制机制。航行在这一海区的商船络绎不绝，而且大多是单独航行。在夜间基本上没有舰艇进行巡逻和保护。
由于美国的航运管理十分混乱，而且也没有象英国人一样采取护航机制，给了德国潜艇部队很大的可乘之机。德国潜艇甚至都不用采取“群狼战术”，只用单艇游猎的方式就能击沉大量的商船，有些潜艇为了节省鱼雷，甚至干脆浮出海面，用舰炮来攻击过往的商船。
截止到1941年12月，在短短的五个月内，德国潜艇共在美国东海岸和加勒比海区击沉了美国、英国和挪威等国的587艘轮船，总吨位超过了350万吨，其中主要是美国商船。同盟国大约有6000多名海员或是乘客死于这一系列海上袭击。
伴随着这一系列的海上袭击行动，潜艇部队自然又涌现出一批新的击沉吨位在5万吨以上的王牌艇长。
德国潜艇部队给美国的工业生产造成了沉重的打击，特别是波多黎各的美国殖民地，它损失了全部商船的四分之一。这甚至影响到了美国国内的食糖和咖啡供应。由于损失了百分之三十的油轮，美国东海岸许多城市的石油供应也都出现了短缺。
实在忍受不了如此沉重的打击的美国海军不得不抽出大量的驱逐舰来建立新的护航制度，在1942年初，这一体系又扩大到了加勒比海地区。
随着护航制度的建立，德国潜艇部队的战绩迅速减少，已经很少能再寻找到合适的攻击机会了。
但是就在设得兰战役开始打响的时候，12个潜艇支队48艘远洋潜艇却悄然离开了比斯开湾和直布罗陀基地，驶向了北美海域。
在另一个时空中，即使是德国人由于《凡尔赛条约》的限制，在一战后遭遇了十五年的潜艇发展停滞期，但在二战期间纳粹德国的潜艇建造技术仍然领先于整个世界大约有十年的时间。而在这个时空，由于奥地利海军一直以来的积累，德国海军在潜艇研发方面的技术储备和工业能力要比另一个时空中深厚得多。
现在的帝国海军中，已经有大约二十艘装备有“沃尔特”封闭式循环系统涡轮发动机的轻型水下高速潜艇投入到了实战之中。不过，由于“沃尔特”水下涡轮发动机目前还处于实验阶段，这些装备这种使用过氧化氢燃料发动机的潜艇只有300吨左右，目前只能在近海活动，帝国海军最新的uⅹⅺ/41d型远洋攻击潜艇依然还是采用传统的柴-电推进方式。
uⅹⅺ/41d型潜艇水下排量超过了2600吨，装备有四台man式2800马力12缸对式柴油机，总功率超过了10000马力，使得其水面航速能够达到22.5节，足以跟随水面舰队一起行动，而且其装备的两台3200马力的主推进电机使得此级潜艇能够在水下获得近12节的潜航速度，虽然其以此高速的续航时间只有不到2小时，但也足以使得其能够摆脱大部分水面反潜舰艇和反潜飞机的追踪了。