最终的决战开始了，而那战局的变化完全出乎了蚩尤的预料，原本战无不胜的巨人们遇到了对手，而鳄神府果然霸道非常，只见它一脚将一个巨人踩在脚下，同时那巨口一张就将另一个巨人咬成两截，吞了下去，而剩下的巨人不是被那组成军阵的黄帝士卒用军阵围住，然后用沾有玉虚符水的武器刺伤，最后骨软筋麻倒地不起，最后被乱剑分尸，而那些修士杀起来更是厉害，那真武一人用北斗七星旗防御，七星剑进攻，一人就杀了不少蚩尤的手下，而那广成子等人也使出法宝乱打，尤其是那番天印一出之下地动山摇，而那黄龙真人、应龙、玉鼎真人更是厉害，那玉鼎真人化为一玉石宝鼎，镇压四方，鼎有显赫、尊贵、盛大之意，而这玉鼎真人之玉石宝鼎原身更是厉害，乃天成之物，更是无可匹敌，而同时那黄龙真人也化为九爪黄龙之身和应龙所话的应龙原身一起，与那玉鼎真人为的玉石宝鼎在乱军之中乱飞，这三人合力之下，居然比那鳄神府杀的人还多，那黄帝看到那黄龙真人所化的九爪黄龙之身在军中飞舞的雄姿，和那玉鼎真人化为的玉石宝鼎镇压一切的霸气，心中神往不一，那黄帝心中当即决定，此战过后，要以这九爪黄龙为自己一族的图腾，而以手中轩辕剑为军中之柄，而要以那广成子番天印为原形为掌权象征为印信，而后要收集蚩尤手下的武器铸造一尊以那玉鼎真人化为的玉石宝鼎为原形的铜鼎为立国重器，为国家和权力的象征。
而在黄帝浮想联翩的时候蚩尤待不住了，急忙下令那风伯、雨师刮风布雨助阵，当那风伯、雨师领命当即刮风布雨，那九天玄女一瞧，祭起一件先天灵宝，名字唤作素色云界旗。此旗又名聚仙旗，是那先天混沌清气孕育而成，摇一摇众仙便受牵引，本为王母所掌，此次不过是借与九天玄女暂用。只见九天玄女将旗一摇，便招来那火中女神女魃，那女魃乃火中精灵，身有异能，全身燃烧着火焰，所过之处，水汽皆散，雨师、风伯心中惊惧，知道这女魃是自己两人的克星，料想无法占得上风，便望蚩尤退去处，蚩尤一见雨师、风伯也是败退，知道不好，连忙下令退兵退回军寨之中，看见蚩尤大军退回军寨之中，那九天玄女在黄帝耳边说道：“速战速决，迟恐生变！”那黄帝闻言眼前一亮，当即命大军列阵冲锋，硬攻蚩尤大寨。显然铁了心一定要把蚩尤灭在此处。就见黄帝军战车呼啸而去，猛兽跃进营寨横冲直撞，人人奋勇争先。蚩尤军新败，兵卒十不存二。加之营寨新立，简陋不堪，兵无战心。如何能打得过黄帝！一番冲杀，蚩尤军或逃或降，战力顿时瓦解。蚩尤、雨师等人正欲逃跑，却见天空抛下一物，金光粼粼，四面八方将众人罩在中心，却正是天庭捉拿重犯的法宝：天罗地网。因九天玄女等人下界相助人皇，故而将此物带在身边。蚩尤大惊，连忙祭起铁血蚩尤旗，那旗子虽被那真武的北斗七星旗破去，威力大减。却仍然是一件上等灵宝，防御力惊人。只见铁血蚩尤旗在空中不住变幻，变长变大，竟将蚩尤等人完全护在中心。蚩尤、雨师眼见形势稳定，也不着急，静等先前跑出去的风伯带人来救。外面的黄帝等人却傻眼了。广成子祭起翻天印连番攻击，只将铁血蚩尤旗打得微微凹陷，却又眨眼恢复如初，不由丧气不已。他的翻天印此时并没有祭炼纯熟，威力并不太强，只不过是好点的后天法宝罢了，打不穿铁血蚩尤旗却也正常。
九天玄女、应龙等人连番上前攻击，却也收效甚微。众人暗暗焦急，都担心迟恐生变，却又无法可想。广成子暗思若请来几位师兄，定能破得此旗。只是巫族援兵随时可至，只恐来也无用，遂闭口不言。黄帝更是焦急，望着铁血蚩尤旗冥思苦想，却又颓然无计。只得拿眼盯着广成子等一众修士。扫视了一下，却发现真武气定神闲地站在那里，不由喜出望外，上前说道：“真武仙长可有以教我！若能擒杀蚩尤，仙长居大功也。”真武淡淡一笑，说道：“诸人皆打不破铁血蚩尤旗，人皇何不亲自动手？那蚩尤既与共主争帝，共主宜亲自将其擒杀，以显威仪。”此言一出，众皆失色。黄帝虽是广成子之徒，可法力却实在不高。连仙道都尚未得成，又怎能打破铁血蚩尤旗，擒杀大巫蚩尤？然而真武气定神闲，不似作伪。众人都知他是星宿海门下亲传弟子，也不敢说什么，只是这脸色却都不怎么好看了。却见黄帝盯着真武看了半晌，突然仰天大笑，豪气勃发。高声说道：“寡人既为帝，岂可临阵退缩？即便明知不能，也要全力一试。方不负天下万民之望！”言罢，提剑上前，力灌双臂对着铁血蚩尤旗猛刺过去。那铁血蚩尤旗乃是集天地间凶孽之气而成，又将人血滋养，最是阴秽之物。而黄帝乃是天命之主，禀世间王道正气而生，执掌天下大权，为天道眷顾。二人天生相克，此时黄帝心中战意高昂，一心一意要打破铁血蚩尤旗，斩杀蚩尤。一时天人感应，只见无数七彩光芒从天地间涌来，汇聚于黄帝轩辕剑尖，一声刺耳的“刺啦”之声响过，那铁血蚩尤旗竟被划破了一个大缝隙。露出里面惊谔不已的蚩尤等人来。广成子等人一拥而上，将蚩尤捉住，以符印封住其四肢五脏。那边九天玄女将天罗地网一扫，正巧将雨师网罗进去，绑了个结结实实。